Ljimaj se tereti za ratni zločin nad srpskim i albanskim civilima u selu Klečka, marta 1999. godine.
EULEKS-ov sudija ukinuo je kućni pritvor poslaniku Skupštine Kosova Fatmiru Ljimaju i devetorici njegovih saradnika.
Mešovito sudsko veće u Prištini oslobodilo je 2012. Fatmira Ljimaja i trojicu bivših komandanta OVK optužbi za ratne zločine u selu Klečka.
Sud je ustanovio da nema dokaza kojima bi se potkrepila optužnica italijanskog tužioca Maurizio Salustro, po kojoj su Ljimaj i trojica njegovih potčinjenih počinila ratne zločine protiv civilne populacije i ratnih pritvorenika.
Oni su, kako se navodi, bili optuženi za ratne zločine protiv civilnog stanovništva i ratnih zarobljenika, u predmetu poznatom pod nazivom Klečka. Ranije je još šestoro optuženih oslobođeno svih optužbi.
Postupak za zločine u Klečkoj ponovljen je i ponovo je počeo 30. marta, a na jednom od prethodnih ročišta posebnom presudom optužnice su oslobođena šestorica bivših pripadnika OVK, koji su bili optužneni za ratne zločine.
Posebnom odlukom sudsko veće je odlučilo da se nastavi suđenje za Fatmira Ljimaja, Nedžmija Krasnićija, Nasera Šalju i Nasera Krasnićija i od tužioca zatražilo da promeni kvalifikaciju krivićnog dela za koje su oni optuženi.
