Specijalno tužilaštvo Kosova vodi istragu protiv Keljmendija za niz krivičnih prekršaja koji obuhvataju organizovani kriminal, za šta je optužen u BiH.
Keljmendi je uhapšen maja 2013. god. na osnovu naloga EULEKS-ovog tužioca iz Kancelarije Specijalnog tužilaštva Kosova, koji je pokrenuo istragu slučaja.
