Dr Džeković, među sugrađanima poznat kao doktor Mesko, stradao je 2. jula 2010. godine tokom protesta nekoliko stotina Srba zbog otvaranja Administrativne kancelarije kosovske vlade. U eksploziji je povređeno još 11 osoba.
Važio je za izuzetnog stručnjaka i posvećenog lekara, ali i čoveka koji je bio uvek dostupan svojim pacijentima. Zbog profesionalnosti, humanosti i odnosa prema ljudima uživao je veliko poštovanje među građanima, kolegama i prijateljima.
Njegova smrt je veliki gubitak za Mitrovicu, a uspomena na njega i danas živi među porodicom, prijateljima, saradnicima i brojnim generacijama kojima je kao pedijatar pomagao.
U znak sećanja na dr Mesuda Džekovića, ulica Luja Braja, u kojoj je izgubio život, ubrzo nakon njegove smrti preimenovana je u Ulicu dr Mesuda Džekovića.


